一、增强植物的抗逆性。
    有一些生物肥料的菌种接种后，由于在作物根部大量生长繁殖，变成作物根际的优势菌，它们可分泌抗真菌和细菌的抗生素，进而控制多种病菌的生长。VA菌根的菌丝就是由于在作物根部的大量生长，除去能够吸收有益于作物生长的营养元素外，还能够增加作物对水分的吸收，提高作物的抗旱能力。
    二、提高土壤肥力。
    这是有机菌肥的主要功效，比如各种自生、联合或共生的固氮生物肥料，能够固定空气中的氮素，增加土壤中的含氮量；多种分解磷、钾矿物的微生物，如硅酸盐细菌能分解土壤中的钾长石、云母及磷矿石，使其中难溶的磷、钾有效化。
    三、制造和协助农作物吸收营养。
    有机菌肥如“5406”抗生菌肥施用后，由于微生物的活动，不但能增加土壤有效养分，还能产生多种激素类物质和各种维生素，进而促进作物的生长；根瘤菌肥中的根瘤菌向豆科植物一生提供的氮素，占其一生需求量的百分之三十到百分之八十；VA菌根是一种土壤真菌，它能够与多种植物根共生，其菌丝伸出根部很远，能够吸收更多的营养供各种植物利用，其中以对磷的吸收十分明显。
    以上就是使用有机菌肥的好处，希望对大家会有一定的帮助。